Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim17Q7TPM3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms