Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nphp3Q7TNH6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nphp3Q7TNH6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms