Protein–RNA interactions for Protein: Q76MZ3

Ppp2r1a, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp2r1aQ76MZ3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp2r1aQ76MZ3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms