Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl35Q6ZWV7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl35Q6ZWV7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms