Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Igsf3Q6ZQA6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Igsf3Q6ZQA6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms