Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd4Q6ZPR5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd4Q6ZPR5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms