Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc44a1Q6X893 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc44a1Q6X893 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc44a1Q6X893 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc44a1Q6X893 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms