Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift172Q6VH22 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms