Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms