Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Timd4Q6U7R4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Timd4Q6U7R4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms