Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc4Q6S5L9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms