Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms