Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc82Q6PG04 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc82Q6PG04 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc82Q6PG04 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc82Q6PG04 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc82Q6PG04 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc82Q6PG04 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc82Q6PG04 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc82Q6PG04 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc82Q6PG04 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc82Q6PG04 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms