Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RimklaQ6PFX8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms