Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms