Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmeff1Q6PFE7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms