Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtifQ6PEE2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtifQ6PEE2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms