Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trak1Q6PD31 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms