Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zbtb40Q6PCS8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zbtb40Q6PCS8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms