Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Papd7Q6PB75 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Papd7Q6PB75 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms