Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsen2Q6P7W5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms