Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smchd1Q6P5D8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smchd1Q6P5D8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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