Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp12Q6P5B0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms