Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg2aQ6P4T0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms