Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm2bQ6P1G2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm2bQ6P1G2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms