Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrimpolQ6P1E7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrimpolQ6P1E7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms