Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Pprc1Q6NZN1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pprc1Q6NZN1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms