Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Soga3Q6NZL0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Soga3Q6NZL0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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