Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI8

Cxxc4, CXXC-type zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc4Q6NXI8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cxxc4Q6NXI8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cxxc4Q6NXI8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms