Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HelbQ6NVF4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms