Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms