Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms