Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm5416Q6IE28 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm5416Q6IE28 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm5416Q6IE28 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm5416Q6IE28 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Gm5416Q6IE28 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Gm5416Q6IE28 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5416Q6IE28 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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