Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edrf1Q6GQV7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edrf1Q6GQV7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms