Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6GQU0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6GQU0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6GQU0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms