Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q6DFW0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q6DFW0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q6DFW0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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