Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rftn1Q6A0D4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rftn1Q6A0D4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms