Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk13Q69ZA1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk13Q69ZA1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms