Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spty2d1Q68FG3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms