Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fnip1Q68FD7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms