Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CltcQ68FD5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms