Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp9cQ66X01 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp9cQ66X01 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp9cQ66X01 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp9cQ66X01 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp9cQ66X01 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrp9cQ66X01 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms