Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q66JV7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q66JV7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q66JV7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q66JV7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q66JV7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q66JV7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q66JV7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q66JV7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms