Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf260Q62513 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf260Q62513 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf260Q62513 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf260Q62513 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf260Q62513 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf260Q62513 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf260Q62513 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Znf260Q62513 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Znf260Q62513 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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