Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lcn3Q62471 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms