Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vat1Q62465 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms