Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sprr1bQ62267 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sprr1bQ62267 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms