Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sall3Q62255 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sall3Q62255 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sall3Q62255 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms