Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttf1Q62187 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms