Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rbm38Q62176 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rbm38Q62176 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rbm38Q62176 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbm38Q62176 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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